サブチリシン触媒作用機構


生きているウェブサイトの外観は、Asp-32、His-64、および触媒的トライアドに存在する生存ウェブサイトSer-221を含む電荷リレー配置を示す。電荷リレー配置は以下のように機能する:Asp-32のカルボキシレート側鎖は、His-64のイミダゾール環上の窒素結合プロトンと水素結合する。これは、Aspが生理学的pHにおいて異常に応答可能であるためにアクセス可能である。 His-64水素上に付加した窒素は、Ser-221のO-Hプロトンと結合する。これは、O-Hの電荷分離において、酸素原子が求核性を付加して、交互作用の後処理に耐える。これにより、Ser-221の酸素原子が、Asn-155の隣接するカルボキシアミド側鎖によって補助されて、進入基質(すなわちペプチド結合)を進めることが可能になる。
Asp-32、His-64、およびSer-221が順番に遠く離れていることを認めても、生きている部位の解剖学的構造に3D解剖学的構造で組み立てられます。
上で宣言された相互作用を解消するために、Ser-221は求核体として作用し、その部分的に酸素原子を排除してペプチド結合を切断する。これは、サブチリシンの電荷リレーサイトの属性のためにアクセス可能です。